• Notre structure repose sur les adhérents qui se réunissent une fois par an en assemblée générale pour approuver le rapport d'activité du syndicat et les comptes financiers.
• Puis, ils élisent un conseil syndical composé de 10 à 20 membres qui se réunit au moins 4 fois par an au siège de la FGTA FO à Paris ou en visioconférence.
• Dans ce conseil, les adhérents élisent un secrétaire national, 1 secrétaire adjoint, un trésorier et un trésorier adjoint qui veillent au bon fonctionnement du syndicat et qui remettent en jeu leurs candidatures tous les 2 ans devant l'assemblée générale.
• Cette structuration nationale nous permet de gérer les désignations de nos adhérents à tous les niveaux, de l'établissement au niveau national; de désigner nos représentants auprès de toutes les instances nationales du monde de l'enseignement agricole et surtout de négocier directement les accords syndicaux avec l'union nationale des mfr.
• Une secrétaire fédérale de la FGTA FO est désignée référente auprès de notre syndicat et l'accompagne dans ses actions. Depuis Janvier 2023, il s'agit de Mme Nathalie Denis.

Pour l'année 2026 le conseil syndical de FO MFR est composé de 13 membres de différentes régions de France représentant plusieurs métiers : formateurs, directeurs, personnel technique, administratif.